生化模式凈水主要是靠硝化細菌，硝化細菌從無到有這個過程俗稱掛膜。硝化細菌掛膜需要濾材（細菌屋）；硝化細菌屬于好氧細菌，因此需要氧氣；硝化細菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個情況下，保持25度水溫，硝化細菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個過程叫冷啟動。想快速啟動，可以使用液體硝化細菌，或者添加一些其他已經(jīng)掛膜的濾材進來進行引菌，這個過程叫熱啟動。海水系統(tǒng)應(yīng)為高鹽度的問題，自然掛膜時間比淡水系統(tǒng)要長一倍以上，時間也隨鹽度升高而延長。

循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)一種新型的養(yǎng)殖模式，也叫工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)、室內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)。是一種通過水處理設(shè)備將養(yǎng)殖水凈化處理后再循環(huán)利用的一種養(yǎng)殖模式。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)融入了生物學(xué)、工程學(xué)、流體力學(xué)、環(huán)境工程學(xué)、信息學(xué)等多種學(xué)科的知識，是一個多學(xué)科，多領(lǐng)域技術(shù)交叉，具有較強技術(shù)含量的系統(tǒng)。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)是以工業(yè)化手段主動控制水環(huán)境。

傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式如池塘養(yǎng)殖和網(wǎng)箱養(yǎng)殖，存在著占地面積大，適合養(yǎng)殖的地域有限，污染環(huán)境，易受地理氣候條件影響，容易因自然災(zāi)害造成減產(chǎn)等劣勢，其越來越嚴重的環(huán)境問題和產(chǎn)品安全性問題，難以實現(xiàn)可持續(xù)性發(fā)展。與傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式相比，循環(huán)水養(yǎng)殖生產(chǎn)每單位水產(chǎn)品可以節(jié)約50～100倍的土地和160～2600倍的水，比傳統(tǒng)養(yǎng)殖節(jié)約90%～99%的水和99%的土地，并且?guī)缀醪晃廴经h(huán)境。