在藻類生長所需的大量元素中，磷、氮通常是水體浮游植物增長的限制性因子，總氮大于1.2毫克/升、總磷大于0.11毫克/升時水體開始富營養(yǎng)化，在淡水中當總磷小于0.1毫克/升時藻類生長發(fā)展為磷限制。而過高的磷輸入如總磷為1.65毫克/升，并不能促進藻類生長。要培養(yǎng)出養(yǎng)殖所需要的有益藻、抑制藍藻、裸藻等有害藻，我們需要重點關注一些化學指標，總堿度、硬度、鹽度、氮、磷、碳以及微量元素鈣、鐵、錳、鋅等有可能成為限制性因子的指標。池塘中的有機質含量可通過檢測水中有機耗氧量得知，水中有機質含量高，氮磷的含量也會高，在降氨氮同時可以降低水體有機質含量。

但目前來看，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖技術和系統(tǒng)的推廣還存在以下問題：是基礎建設成本高，投入大。現(xiàn)在采用循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的企業(yè)大多數(shù)為具有一定規(guī)模，技術力量和實力較為雄厚的養(yǎng)殖企業(yè)，而對大部分小本經(jīng)營的養(yǎng)殖戶（單位）來說是可望而不可即，這也使循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)和技術的大范圍推廣受到了制約。部分工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)由于設計存在問題或其他一些人為原因，運行不充分或運行效率較低，影響了工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的總體水平，節(jié)水節(jié)能技術路線有待進一步探討、完善。

結合工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的特點，研究開發(fā)出節(jié)能環(huán)保，占地面積少，土地使用效率高，能有效隔離病害和控制病源的侵入，降低魚苗的攜菌和發(fā)病率的封閉式工廠化養(yǎng)殖循環(huán)水處理系統(tǒng)：在臺風自然災害較多的南方，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖可有效抵御自然災害對水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)毀滅性的打擊。在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，重要的就是水質的凈化處理，這關乎到水產(chǎn)養(yǎng)殖的成敗。目前，傳統(tǒng)的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)由于大量電力化設備的使用，能耗特別高，加之部分設備耐腐蝕性差，成為現(xiàn)在做循環(huán)水養(yǎng)殖頭疼的事情。