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海洋生物外泌體miRNA芯片

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-04-04

被特定部位的細(xì)胞獲取的瘤子外泌體可為肉瘤的轉(zhuǎn)移準(zhǔn)備轉(zhuǎn)移前微環(huán)境。用肺轉(zhuǎn)傾向的肉瘤細(xì)胞來(lái)源的外泌體處理小鼠后可使骨轉(zhuǎn)傾向的肉瘤細(xì)胞重新定向。外泌體的蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)不同部位傾向性的肉瘤細(xì)胞來(lái)源的外泌體具有不同的整合素(integrin)表達(dá)譜,整合素α6β4和α6β1與肺轉(zhuǎn)有關(guān),而整合素αvβ5與肝轉(zhuǎn)有關(guān)。敲低整合素α6β4和αvβ5可減少外泌體被靶部位細(xì)胞獲取,進(jìn)而分別降低了肺和肝的轉(zhuǎn)移。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)外泌體整合素被細(xì)胞獲取后活躍了Src的磷酸化和促炎的S100基因的表達(dá)。通過(guò)臨床數(shù)據(jù)分析顯示外泌體整合素可作為預(yù)測(cè)肉瘤轉(zhuǎn)移的部位傾向性的診斷指標(biāo)。采用磁珠法時(shí),外泌體生物活性易受PH和鹽濃度影響。海洋生物外泌體miRNA芯片

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流式細(xì)胞技術(shù)是細(xì)胞和小顆粒定性和定量表征的有效方法,其用于外泌體定量檢測(cè)的準(zhǔn)確性也在不斷上升。將外泌體表面特異性標(biāo)志物CD63、CD81等相應(yīng)抗體進(jìn)行標(biāo)記,可用流式細(xì)胞儀檢測(cè)到陽(yáng)性表達(dá),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)外泌體的定量。但流式細(xì)胞技術(shù)檢測(cè)時(shí)需要單顆粒懸浮液,當(dāng)外泌體濃度高或分離過(guò)程中發(fā)生外泌體囊泡聚集時(shí)將導(dǎo)致一次觀(guān)察到多個(gè)顆粒,從而導(dǎo)致數(shù)據(jù)不準(zhǔn)確。因此,為了通過(guò)流式細(xì)胞儀觀(guān)察,需要將外泌體通過(guò)免疫捕獲或共價(jià)結(jié)合固定在磁珠表面上,從而便于將外泌體囊泡暴露于已知或者預(yù)期在外泌體表面表達(dá)的抗原的熒光偶聯(lián)抗體中。在流式細(xì)胞術(shù)之前,可以在落射熒光顯微鏡(EPI)下觀(guān)察與磁珠和熒光抗體偶聯(lián)的外泌體囊泡。當(dāng)樣品通過(guò)流式細(xì)胞儀時(shí)采集熒光信號(hào),不只可以對(duì)外泌體進(jìn)行高通量分析,還可以基于抗原表達(dá)對(duì)外泌體進(jìn)行定量或分類(lèi)。杭州腹膜透析液外泌體外泌體膜蛋白可以被蛋白酶剪切,剪切的碎片可以作為配體與細(xì)胞膜上的受體結(jié)合,從而活躍細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)通路。

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超速離心是外泌體提取較常用的方法也被認(rèn)為是金標(biāo)準(zhǔn),主要是根據(jù)外泌體的沉降系數(shù)、大小和形狀將其分離出來(lái)。首先4℃低速離心(300-500g,10min)去除死細(xì)胞以及細(xì)胞碎片,隨后以較高離心速度(2000xg,10min)去除生物聚合物以及凋亡小體,然后用10000xg,30min離心去除大型囊泡,結(jié)尾以超速離心沉淀外泌體。通過(guò)懸浮以及重復(fù)超速離心去除外泌體沉淀中的非外泌體蛋白。超速離心法具有操作簡(jiǎn)單、不易被分離試劑污染、獲得的外泌體數(shù)量較多等優(yōu)點(diǎn)。但是此方法需要昂貴的超高速離心機(jī),每次處理的樣本量較小,費(fèi)時(shí),電鏡鑒定時(shí)還發(fā)現(xiàn)外泌體易聚集成塊,且上清中仍能檢測(cè)到大型囊泡,純度不高,另外高速離心會(huì)損傷外泌體影響下游實(shí)驗(yàn)。外泌體通過(guò)內(nèi)體途徑分泌到細(xì)胞外空間,并將各種生物活性分子(貨物)轉(zhuǎn)運(yùn)至靶細(xì)胞。

質(zhì)膜的連續(xù)內(nèi)陷較終導(dǎo)致多泡體的形成,多泡體可與細(xì)胞內(nèi)的其他囊泡和細(xì)胞器交叉,從而增加了外泌體成分的多樣性。根據(jù)細(xì)胞來(lái)源的不同,細(xì)胞外囊泡,包括外泌體,可以包含細(xì)胞的許多成分,包括DNA、RNA、脂質(zhì)、代謝物、胞質(zhì)和細(xì)胞表面蛋白。目前產(chǎn)生外泌體的生理目的尚不清楚,需要進(jìn)一步研究。一個(gè)推測(cè)的作用是外泌體可能從細(xì)胞中去除多余和/或不必要的成分以維持細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定。較近的研究也表明外泌體中特定細(xì)胞成分的功能、靶向、機(jī)制驅(qū)動(dòng)的積累,提示它們?cè)谡{(diào)節(jié)細(xì)胞間通訊中發(fā)揮作用。外泌體是指包含了復(fù)雜RNA和蛋白質(zhì)的小膜泡(30-150nm)。

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近年來(lái),外泌體的捕獲技術(shù)越來(lái)越多,微流體系也被用于外泌體提取,此方法能根據(jù)其物理和生化特性同時(shí)分離外泌體。采用這種方法獲得的樣品純度高,且可及時(shí)獲取外泌體用于疾病的相關(guān)檢測(cè)。在初次注射時(shí)外泌體粘附在微流控設(shè)備的內(nèi)表面,并在隨后的PBS注射中沖洗掉。此方法采用的設(shè)備復(fù)雜,所需的樣本量取決于流動(dòng)通道的長(zhǎng)度。另外,樣品量的注入速率比較低,因此,對(duì)于大樣品量,將需要較長(zhǎng)的處理時(shí)間。外泌體在包括瘤子在內(nèi)的各種疾病的發(fā)病機(jī)理中具有重要的功能。目前,研究人員已經(jīng)開(kāi)發(fā)了多種方法來(lái)分離外泌體,離心技術(shù)仍然是常用方法,其他方法,例如過(guò)濾、磁珠分離和色譜法等,也顯示出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),但目前仍然沒(méi)有一種公認(rèn)有效的提取方法,研究人員應(yīng)針對(duì)不同來(lái)源的樣本以及不同的下游分析選取較適宜的提取方案。外泌體屬于胞外囊泡類(lèi),除了外泌體之外細(xì)胞還分泌微泡以及其它的膜囊泡。pkh67

對(duì)外泌體的分析和檢測(cè)可以輔助疾病的早期診斷、療效評(píng)價(jià)和預(yù)后分析。海洋生物外泌體miRNA芯片

密度梯度離心法根據(jù)在蔗糖、碘海醇或碘克沙醇等惰性溶液中的浮力密度將外泌體分成特定的層,目前普遍應(yīng)用的是蔗糖,這種方法可以成功地將亞細(xì)胞成分(例如過(guò)氧化物酶體,線(xiàn)粒體和核內(nèi)體)分離到密度梯度溶液中的不同層中。樣品被放置在梯度的頂部,當(dāng)施加離心力時(shí),樣品中的顆粒以獨(dú)特的速率通過(guò)梯度,該梯度以從上到下的密度增加。樣品中的外泌體將在1.13-1.19g/ml的密度范圍富集,隨后可以通過(guò)分餾收集,密度梯度超速離心對(duì)從蛋白質(zhì)聚集體和非膜顆粒中分離出外泌體非常有效。此方法獲得的外泌體純度較高,但步驟繁瑣、費(fèi)時(shí)且會(huì)造成外泌體損失。海洋生物外泌體miRNA芯片

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