冷凍電鏡技術基本原理之三維冷凍電鏡技術:樣品經過在液氮中的冷凍固定,使得生物大分子中的H2O分子以玻璃態(tài)的形式存在,保持低溫,將樣品放入顯微鏡,高度相干的電子作為光源從上面照射下來,透過樣品和附近的冰層,受到散射,利用探測器和透鏡系統(tǒng)把散射的信號成像記錄下來,再進行信號處理,較后利用三維重構的技術得到樣品的三維結構。冷凍電鏡技術的獨特優(yōu)勢分辨率高:光學顯微鏡的分辨率為0.2μm,透射電子顯微鏡的分辨率為0.2nm,透射電子顯微鏡在光學顯微鏡的基礎上放大了1000倍。冷凍電鏡技術中的單顆粒分析法在分析具有同質性結構的樣品時表現出更方便、更優(yōu)異的成像能力。廈門快速冷凍顯微鏡技術服務中心單顆粒冷凍電...
什么是冷凍電鏡技術?冷凍電鏡技術,全稱是冷凍電子顯微鏡技術,是在低溫下使用透射電子顯微鏡觀察樣品的顯微技術。冷凍電鏡技術,是一種重要的結構生物學研究方法,它與X射線晶體學、核磁共振一起構成了高分辨率結構生物學研究的基礎。冷凍電鏡技術的研究,主要是冷凍成像和蛋白快速冷凍技術。根據諾貝爾獎評委會的說法,冷凍電鏡技術使生物分子成像,變得更加簡單,把生物化學帶入了一個新紀元。這項技術可以用來確定,溶液中生物分子的高清晰度結構。冷凍電鏡技術其實比較抽象,一直以來它主要的問題是其圖像噪音極高、信號極低,研究的目標是從中提取近原子分辨率的結構信息??梢孕蜗蟮谋扔鳛樵谝粋€機器轟鳴的工廠,監(jiān)測一只螞蟻爬行的聲音...
冷凍電鏡技術基本原理之三維冷凍電鏡技術:樣品經過在液氮中的冷凍固定,使得生物大分子中的H2O分子以玻璃態(tài)的形式存在,保持低溫,將樣品放入顯微鏡,高度相干的電子作為光源從上面照射下來,透過樣品和附近的冰層,受到散射,利用探測器和透鏡系統(tǒng)把散射的信號成像記錄下來,再進行信號處理,較后利用三維重構的技術得到樣品的三維結構。冷凍電鏡技術的獨特優(yōu)勢分辨率高:光學顯微鏡的分辨率為0.2μm,透射電子顯微鏡的分辨率為0.2nm,透射電子顯微鏡在光學顯微鏡的基礎上放大了1000倍。雖然冷凍電鏡技術屬于前沿技術,但目前已經有利用冷凍電鏡基于結構研發(fā)的藥物進入臨床試驗。莆田原位冷凍電鏡技術服務中心冷凍電鏡技術也正...
單顆粒冷凍電鏡技術的圖像處理技術:經過多年的發(fā)展,目前冷凍電鏡的數據處理部分主要包含了以下的流程:(1)襯度傳遞函數的修正(CTFcorrection);(2)樣品分子投影數據的篩選(particleselection);(3)二維投影數據的分類和降噪(2Danalysis);(4)三維模型的重構和優(yōu)化(3Dreconstructionandrefinement);(5)多重構象的結構分析(heterogeneityanalysis);(6)對重建結構分辨率的分析(structureresolutionassessment);(7)結合生物化學原理和實驗數據對三維結構的解讀(modelinte...
冷凍電鏡技術解析結構的一般流程是怎樣的?對樣品的要求是什么?冷凍電鏡解析蛋白結構一般流程為:蛋白表達純化;負染樣品準備:約2小時完成;負染樣品的數據收集:約8小時完成;冷凍樣品的準備:約4小時完成;冷凍樣品的數據收集:48-120小時完成。三維結構重建。冷凍電鏡解析蛋白結構對蛋白質的要求:分子量:一般需要樣品的分子量在200kD以上。緩沖液:緩沖液中不能含有多糖,DMSO,甘油等有機物質,這些會降低樣品的襯度,難以獲得高分辨的三維結構。一般而言,緩沖液為20mMHepes,150mMNaCl。濃度:一般而言,可溶性蛋白濃度應在1mg/ml左右,膜蛋白應保證濃度在5mg/ml左右。體積:20ul...
冷凍電子顯微鏡技術中單顆粒重構技術:該技術也叫做單顆粒分析,主要適用于結構具有全同性的生物大分子的結構解析,蛋白質的分子量通常要求在100KD以上,在顆粒數目足夠多的情況下,理論上其分辨率可以達到原子水平。該方法的圖像處理和三維重構計算過程如下:從原始的電鏡照片中將顆粒圖像挑選出來,對其進行二維圖像對中、分類和平均,然后通過計算等價線的方法推算各分類圖的取向,利用傅里葉重構法建立始三維結構模型,通過對原始圖片或分類平均圖與結構模型投影的匹配,優(yōu)化取向參數,進而得到更準確的三維結構模型,如此反復對初始結構模型進行修正,直到收斂獲得較終的結果。單顆粒重構技術近年來發(fā)展迅速,應用普遍,不斷有文章報道...
冷凍電鏡技術原理之電子斷層掃描成像技術:通過在顯微鏡內傾轉樣品從而收集樣品多角度的電子顯微圖像并對這些電子顯微圖像根據傾轉幾何關系進行重構的方法稱為電子斷層掃描成像技術。該方法主要應用于細胞及亞細胞器,以及沒有固定結構的生物大分子復合物(分子量范圍為800kD),Zgao分辨率約2nm。冷凍電鏡的分類:目前我們討論的冷凍電鏡基本上指的都是冷凍透射電鏡,但是如果我們以使用冷凍技術的角度定義冷凍電鏡的話,冷凍電鏡主要可以分為冷凍透射電鏡、冷凍掃描電鏡、冷凍蝕刻電子顯微鏡。冷凍電鏡技術之冷凍掃描電鏡是防止樣品丟失水分的特別有效方法,它能應用于任何真空狀態(tài)。汕頭透射電子顯微鏡技術特點冷凍電鏡技術是在2...