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Protein AG免疫沉淀外包公司

來源: 發(fā)布時間:2024-07-29

ChIP(染色質(zhì)免疫沉淀)實(shí)驗(yàn)是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計概述:
1. 目標(biāo)蛋白的選擇:確定您想要研究的目標(biāo)蛋白,例如特定的轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾。
2. 樣本的準(zhǔn)備:根據(jù)研究的需要選擇合適的細(xì)胞或組織樣本。
3. 抗體的選擇:選擇具有高特異性和親和力的抗體,這對于實(shí)驗(yàn)的成功至關(guān)重要。
4. 交聯(lián):使用甲醛等交聯(lián)劑將蛋白質(zhì)與DNA在體內(nèi)共價結(jié)合,形成穩(wěn)定的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物。
5. 細(xì)胞裂解:裂解細(xì)胞以釋放染色質(zhì),同時保持蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物的完整性。
6. 染色質(zhì)的剪切:通過超聲或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當(dāng)大小的片段,通常在200-1000 bp之間。
7. 免疫沉淀:使用特定抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,然后利用蛋白A/G磁珠沉淀復(fù)合物。
8. 洗滌和洗脫:洗滌沉淀物以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和DNA,然后洗脫目標(biāo)蛋白-DNA復(fù)合物。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián):使用蛋白酶K處理樣品以逆轉(zhuǎn)交聯(lián),釋放DNA。
10. DNA的純化和分析:純化DNA并使用qPCR、芯片或測序技術(shù)(如ChIP-seq)進(jìn)行分析。
免疫沉淀技術(shù)IP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計。Protein AG免疫沉淀外包公司

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免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實(shí)驗(yàn)步驟通常包括以下幾個關(guān)鍵環(huán)節(jié):
1. 細(xì)胞裂解:首先需要收集細(xì)胞并裂解它們,以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。這通常通過添加含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液來完成,以防止蛋白質(zhì)降解。
2. 裂解物上清:裂解后的細(xì)胞混合物通常需要通過離心來去除未破碎的細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞,從而獲得上清。
3. 抗體的添加:將特定于目標(biāo)蛋白的抗體加入到裂解物中。這些抗體將特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白上。
4. 免疫復(fù)合物的形成:抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合形成免疫復(fù)合物。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲:使用Protein A/G結(jié)合的磁珠來捕獲免疫復(fù)合物。
6. 洗滌:捕獲免疫復(fù)合物后,需要用裂解/洗滌緩沖液多次洗滌,以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他污染物。
7. 洗脫:免疫復(fù)合物可以通過加入SDS樣品緩沖液進(jìn)行洗脫,這將導(dǎo)致抗體和抗原變性并從珠子上釋放下來,或者使用低pH緩沖液進(jìn)行溫和洗脫,以保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象。
8. 分析:洗脫后的樣品可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot等方法進(jìn)行分析,以驗(yàn)證目標(biāo)蛋白的存在和狀態(tài)。
上海anti DYKDDDDK免疫沉淀技術(shù)服務(wù)免疫沉淀技術(shù)ChIP的應(yīng)用有哪些?

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ChIP(染色質(zhì)免疫沉淀)實(shí)驗(yàn)是一種強(qiáng)大的技術(shù),用于研究蛋白質(zhì)與DNA之間的相互作用,尤其是在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)、復(fù)制以及表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域。然而,像所有實(shí)驗(yàn)技術(shù)一樣,ChIP實(shí)驗(yàn)也有其優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)。
ChIP實(shí)驗(yàn)的優(yōu)點(diǎn):
1. 體內(nèi)反應(yīng)的反映:ChIP提供了一種在體內(nèi)研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的方法,能夠真實(shí)、完整地反映結(jié)合在DNA序列上的靶蛋白的調(diào)控信息。
2. 全基因組覆蓋:ChIP技術(shù)可以覆蓋整個基因組,提供關(guān)于蛋白質(zhì)-DNA相互作用的視圖。
3. 適用于多種蛋白質(zhì):ChIP可以用來研究組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子以及其他DNA結(jié)合蛋白。
ChIP實(shí)驗(yàn)的缺點(diǎn):
1. 實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣。
2. 需要大量起始材料:ChIP實(shí)驗(yàn)通常需要大量的細(xì)胞或組織作為起始材料。
3. 交聯(lián)的影響:使用交聯(lián)劑可能會改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),從而影響抗體的識別和蛋白質(zhì)-DNA的相互作用。
4. 染色質(zhì)碎裂的分辨率:染色質(zhì)碎裂的效率和分辨率直接影響ChIP的準(zhǔn)確性,需要優(yōu)化以獲得結(jié)果。
5. 抗體質(zhì)量:抗體的質(zhì)量對實(shí)驗(yàn)結(jié)果至關(guān)重要,但高質(zhì)量、特異性強(qiáng)的抗體可能難以獲得或成本較高。

免疫沉淀技術(shù)的實(shí)驗(yàn)方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準(zhǔn)備
2. 細(xì)胞裂解:使用裂解緩沖液(含有蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解)裂解細(xì)胞,釋放蛋白質(zhì)。
3. 蛋白質(zhì)濃度測定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。
4. 抗體預(yù)處理:如果使用預(yù)固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反應(yīng):將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)充分結(jié)合。
6. 固相支持物的回收:對于未固定的抗體,加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物。
7. 洗滌:去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì),通常需要多次洗滌固相支持物。
8. 洗脫:使用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復(fù)合物。
9. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質(zhì)譜分析等,以進(jìn)一步分析目標(biāo)蛋白質(zhì)。
10. 對照實(shí)驗(yàn):包括正對照(已知能沉淀目標(biāo)蛋白的抗體)和負(fù)對照(非特異性抗體或無抗體)以驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的特異性。
免疫沉淀技術(shù)ChIP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計。

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免疫沉淀技術(shù)RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)是一種用于研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。RIP技術(shù)可以幫助我們了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)過程,并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調(diào)節(jié)靶點(diǎn)。
RIP技術(shù)的原理是利用針對特定RNA結(jié)合蛋白的抗體,將細(xì)胞內(nèi)的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物沉淀下來。然后,可以通過分離純化,對這些復(fù)合物中的RNA進(jìn)行檢測,如qPCR驗(yàn)證或測序分析。
表觀遺傳學(xué)和RNA生物學(xué)領(lǐng)域?qū)Σ煌琑NA作用和功能的關(guān)注增加。RNA-蛋白質(zhì)相互作用能夠調(diào)控mRNA和非編碼RNA的功能。對RNA潛能的這一新認(rèn)識帶動了新方法的發(fā)展,使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質(zhì)相互作用。
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免疫沉淀技術(shù)RIP的實(shí)驗(yàn)方法。Protein AG免疫沉淀外包公司

免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因:
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低,則有幾種方法可以進(jìn)行優(yōu)化。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分。使用普通微珠預(yù)純化樣本還可以降低非目標(biāo)分子的共純化。此外,還可以使用無關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中會出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會影響下游分析,則需要使用抗體通過共價連接固定至微珠的方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn),如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
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標(biāo)簽: 支原體 免疫沉淀