5'DNA腺苷酰化試劑盒是一種用于將單鏈DNA(ssDNA)5'端腺苷?;揎椀膶?shí)驗(yàn)工具,其主要應(yīng)用于miRNA等3'端為羥基的RNA或單鏈DNA在克隆、高通量測序建庫或PCR檢測等時(shí),在3'端添加的接頭的制備。以下是5'DNA腺苷酰化試劑盒的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和使用方法:1.**高效轉(zhuǎn)化**:該試劑盒能將95%以上的5'端磷酸化的DNA(pDNA)轉(zhuǎn)化成腺苷酰化DNA(AppDNA),從而提高產(chǎn)量并避免膠回收提純步驟。2.**操作簡便**:單步反應(yīng)即可完成腺苷酰化,無需復(fù)雜的操作或額外的純化步驟。3.**高溫反應(yīng)**:在65℃的高溫下進(jìn)行反應(yīng),這有助于避免DNA或RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)腺苷?;磻?yīng)的干擾。4.**適用性廣**:適用于pmol級(jí)別至μmol級(jí)別的底物量,可以方便地根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要放大反應(yīng)體系。5.**組成成分**:試劑盒通常包含腺苷?;?Adenylase)、ATP和所需的緩沖液,以及用于啟動(dòng)反應(yīng)的5'-磷酸化的單鏈DNA。6.**保存條件**:一般建議在-20℃保存,有效期至少一年,長期儲(chǔ)存建議在-70℃。7.**注意事項(xiàng)**:底物單鏈DNA或RNA的5'端磷酸化是必須的,而3'端可以進(jìn)行氨基化等封閉,也可以不封閉。反應(yīng)完成后推薦在85℃孵育5分鐘以失活A(yù)denylase,防止去腺苷?;F(xiàn)象。來源于 Thermococcus kodakaraensis,具有高熱穩(wěn)定性和校正能力,適用于長片段PCR和熱啟動(dòng)PCR。RNase H
Blood Direct PCR Master Mix (2×)的組分通常包括以下幾類:高保真DNA聚合酶:例如,NEB的Q5 Blood Direct 2X Master Mix中包含的Q5 Hot Start High-Fidelity DNA Polymerase,這是一種熱穩(wěn)定性DNA聚合酶,具有3'→5'核酸外切酶活性,并與Sso7d結(jié)構(gòu)域融合以增強(qiáng)過程性3940。dNTPs:提供DNA合成所需的四種脫氧核苷三磷酸。優(yōu)化的緩沖體系:包含適合于血液樣本PCR擴(kuò)增的pH和離子強(qiáng)度,以及能夠抵抗血液樣本中抑制劑的特殊成分。穩(wěn)定劑:保證預(yù)混合溶液在儲(chǔ)存和使用過程中的穩(wěn)定性??挂种苿┏煞郑阂恍〣lood Direct PCR Master Mix含有能夠抵抗血液樣本中可能存在的PCR抑制劑的成分??蛇x的染料:某些產(chǎn)品可能含有用于電泳的染料,允許PCR產(chǎn)物直接上樣進(jìn)行電泳分析,無需額外的上樣緩沖液。其他可選組分:根據(jù)需要,可能包括MgCl2、EDTA、DMSO等,用于優(yōu)化特定樣本或反應(yīng)條件42。Recombinant Rat Serpina3n Protein,His Tag牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I具有解超螺旋的活性,可以解開雙鏈閉合環(huán)狀DNA的超螺旋結(jié)構(gòu),便于后續(xù)的酶切反應(yīng)。
磁珠本身并不直接參與電泳過程,但它們可以用于電泳后的樣品處理,特別是在核酸(DNA或RNA)的提取和純化過程中。以下是使用磁珠進(jìn)行電泳后樣品處理的一般步驟:1.**凝膠電泳**:-首先,將DNA或RNA樣品通過凝膠電泳進(jìn)行分離。凝膠通常是瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠,根據(jù)樣品的大小和類型選擇合適的凝膠濃度和緩沖體系。2.**觀察和切割**:-電泳完成后,使用紫外線照射凝膠并使用適當(dāng)?shù)娜玖希ㄈ鏓B或SYBRGreen)對(duì)DNA或RNA進(jìn)行染色,以在紫外光下觀察到DNA或RNA的條帶。3.**樣品提取**:-確定目標(biāo)DNA或RNA條帶后,使用干凈的工具(如切割器或移液槍)從凝膠中切割出含有目標(biāo)分子的凝膠片段。4.**磁珠準(zhǔn)備**:-根據(jù)磁珠試劑盒的說明書,準(zhǔn)備磁珠。通常包括磁珠的重懸和可能的表面修飾,以確保它們能夠特異性地結(jié)合目標(biāo)核酸。5.**樣品與磁珠混合**:-將切割出的凝膠片段轉(zhuǎn)移到含有磁珠的溶液中,溫和地混合以促進(jìn)磁珠與核酸的結(jié)合。6.**磁分離**:-將含有磁珠和核酸的混合物置于磁分離架上,利用磁場使磁珠快速聚集在管底,從而實(shí)現(xiàn)與溶液的分離。7.**洗滌**:-移除未結(jié)合的溶液,向磁珠上加入洗滌液,再次進(jìn)行磁分離以去除雜質(zhì)。
pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過改造的高活性Tn5轉(zhuǎn)座酶,與ProteinA融合,形成一種新型融合酶,應(yīng)用于CUT&Tag技術(shù)中,用于研究蛋白質(zhì)與基因組DNA的相互作用。這種融合酶具備以下特點(diǎn):1.**高活性**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是超高活性的突變形式,體外轉(zhuǎn)座效率比野生型高1000倍。2.**ProteinA融合**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的N端結(jié)構(gòu)域?yàn)镻roteinA的一部分,可以與免疫球蛋白的Fc區(qū)相互作用,特別是與大多數(shù)哺乳動(dòng)物的IgG結(jié)合。3.**Tn5轉(zhuǎn)座酶活性**:C端結(jié)構(gòu)域?yàn)門n5轉(zhuǎn)座酶,能夠特異性識(shí)別轉(zhuǎn)座子兩端反向重復(fù)的ME序列(MosaicEnd),并在形成轉(zhuǎn)座復(fù)合體后隨機(jī)插入靶DNA中。4.**應(yīng)用廣**:適用于CUT&Tag技術(shù)、高通量測序建庫、ATAC-seq等,特別適用于早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、以及表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。5.**操作簡便**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的使用簡化了實(shí)驗(yàn)步驟,可以在一步反應(yīng)中實(shí)現(xiàn)DNA片段化和接頭連接,從細(xì)胞到二代測序文庫的轉(zhuǎn)化過程需9小時(shí)。6.**低細(xì)胞投入量**:CUT&Tag技術(shù)允許從低至60個(gè)細(xì)胞的樣本中獲得結(jié)果,甚至可以應(yīng)用于單細(xì)胞水平的研究。7.**高質(zhì)量結(jié)果**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的使用可以保證DNA片段化,同時(shí)獲得的蛋白純度高、核酸殘留低。全長膜蛋白由于其天然構(gòu)象,是跨膜蛋白藥物開發(fā)中的好的抗原。在細(xì)胞中的表達(dá)水平通常較低。
BloodDirectPCRMasterMix(2×)適合血液樣本的PCR擴(kuò)增主要通過以下幾個(gè)方面:1.**抗血液抑制劑能力**:該預(yù)混合溶液含有的DNA聚合酶和其他成分能夠抵抗血液樣本中的PCR抑制劑,如膽酸鹽、血紅素、蛋白質(zhì)等。2.**優(yōu)化的緩沖體系**:預(yù)混合溶液中的緩沖體系經(jīng)過特別優(yōu)化,以適應(yīng)血液樣本中的特定條件,包括pH、離子強(qiáng)度和Mg2+濃度,從而提高PCR擴(kuò)增的效率和特異性。3.**高保真DNA聚合酶**:包含的DNA聚合酶具有高保真度,能夠在復(fù)制DNA時(shí)減少錯(cuò)誤,保證擴(kuò)增結(jié)果的準(zhǔn)確性。4.**快速擴(kuò)增速度**:一些BloodDirectPCRMasterMix產(chǎn)品具有快速擴(kuò)增的特點(diǎn),可以縮短PCR實(shí)驗(yàn)的時(shí)間。5.**寬泛的GC含量適應(yīng)性**:該產(chǎn)品可以用于擴(kuò)增不同GC含量的基因,包括高GC和低GC區(qū)域,提高了PCR的適用性。6.**直接使用血液樣本**:無需對(duì)血液樣本進(jìn)行DNA提取或純化,可以直接將抗凝血樣品或干血斑樣品加入PCR反應(yīng)中。7.**兼容性**:兼容多種抗凝劑,如EDTA、肝素或檸檬酸鈉,適用于不同來源的血液樣本。8.**簡化的操作流程**:由于省去了DNA提取的步驟,BloodDirectPCRMasterMix簡化了實(shí)驗(yàn)操作流程,減少了實(shí)驗(yàn)時(shí)間和潛在的污染風(fēng)險(xiǎn)。TBE (Thymine base editor):這是一種新型的堿基編輯工具,不依賴脫氨酶,能夠通過人源化尿嘧啶DNA-糖基化酶。Recombinant Mouse Pentraxin 2/SAP Protein,hFc Tag
His-Avi Tag包含了特定肽段,分子量預(yù)測為50.20 kDa,但由于糖基化,其在Tris-Bis PAGE結(jié)果上遷移至55-60 kDa。RNase H
Benzonase核酸酶殘留檢測試劑盒通過以下方式實(shí)現(xiàn)高靈敏性:1.**熒光探針技術(shù)**:試劑盒采用熒光標(biāo)記的DNA探針,這種探針在沒有Benzonase核酸酶的樣品中穩(wěn)定存在且不產(chǎn)生熒光信號(hào)。當(dāng)樣品中含有核酸酶殘留時(shí),核酸酶會(huì)切割熒光標(biāo)記的DNA探針,導(dǎo)致熒光信號(hào)的增強(qiáng)。這種變化可以用來定量分析Benzonase的殘留量,實(shí)現(xiàn)高靈敏度檢測。2.**熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)**:該技術(shù)利用了供體(Donor)和受體(Acceptor)熒光基團(tuán)間的相互作用。在未切割狀態(tài)下,供體的熒光被受體淬滅,而一旦DNA探針被Benzonase切割,供體熒光基團(tuán)與受體分離,熒光信號(hào)增強(qiáng),從而實(shí)現(xiàn)高靈敏度的檢測。3.**優(yōu)化的底物探針**:試劑盒中的Benzonase底物是一種合成的DNA寡核苷酸探針,其一端具有VIC熒光基團(tuán),另一端具有BHQ1淬滅基團(tuán)。這種設(shè)計(jì)使得在底物被切割后,VIC熒光不再被BHQ1淬滅,從而可以非常靈敏地檢測到Benzonase核酸酶活性。4.**高靈敏度的檢測范圍**:試劑盒能夠檢測到低達(dá)約0.002U(約0.003ng)的Benzonase或BeyoZonase,樣品中的Benzonase濃度約為0.0002U/μl或0.3pg/μl,這遠(yuǎn)低于常規(guī)同類產(chǎn)品的檢測限。RNase H