免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能檢測不到低親和力和瞬間的相互作用：低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)之間的相互作用可能檢測不到，這可能導(dǎo)致某些重要的相互作用被遺漏。不能確保直接相互作用：免疫共沉淀不能保證沉淀的蛋白復(fù)合物是由直接相互作用的兩種蛋白組成。兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合，而可能有第三者在中間起橋梁作用。靈敏度限制：免疫共沉淀的靈敏度不如某些其他技術(shù)，如親和色譜，這可能影響到對低豐度蛋白或微弱相互作用的研究。樣本純度要求高：如果將蛋白復(fù)合物直接進行質(zhì)譜分析，需要得到較高純度和濃度的蛋白復(fù)合物樣品，這并非易事，并且成本較高。對抗體要求高：用于免疫共沉淀的抗體不是總是與操作相合適，與Western blotting或者 ELISA相比容易出現(xiàn)假陽性反應(yīng)。免疫共沉淀法可信度高，可發(fā)現(xiàn)新蛋白搭檔，但存局限，需結(jié)合其他方法驗證。湖北免疫共沉淀CoIP

免疫共沉淀CoIP實驗，細胞的收集及裂解方法如下：

收集2E7個細胞樣品，加入PBS洗滌細胞，離心后棄上清收集細胞沉淀。

準備500μl預(yù)冷的CellLysisBuffer,分別加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混勻后加進細胞沉淀中吹打均勻，冰上孵育30min，期間渦旋混勻幾次。

4℃,12000rpm離心10min，取上清，進行蛋白濃度測定及后續(xù)實驗。廣州基云生物，在IP互作組檢測和關(guān)鍵機制分子篩選驗證領(lǐng)域，具有豐富的經(jīng)驗，助力您的互作機制研究，歡迎垂詢合作。 北京互作機制CoIP-MS檢測蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)分子互作實驗方法介紹。

Co-IP（免疫共沉淀）實驗操作的要點。1.細胞裂解：確保采用溫和的裂解條件，以保持細胞內(nèi)存在的蛋白間相互作用。使用非變性裂解液進行裂解和洗滌。2.抗體固定：選擇經(jīng)過驗證的抗體，以減少假陽性結(jié)果。注意抗體與緩沖液的比例，避免抗體稀釋過度或過多。3.抗體結(jié)合：將抗體與樣品混合，確?？贵w與目標蛋白充分結(jié)合。4.磁珠或瓊脂糖添加：將抗體固定的磁珠或瓊脂糖加入混合物中，使其與抗體-蛋白復(fù)合物結(jié)合。5.沉淀：通過磁珠或瓊脂糖的沉降，分離出蛋白復(fù)合物。6.洗脫：使用洗脫緩沖液將蛋白質(zhì)復(fù)合物從磁珠或瓊脂糖上洗脫下來。7.增加洗脫之前的洗滌次數(shù)或在免疫共沉淀緩沖液中加入Triton X-100，以降低非特異性結(jié)合。遵循這些操作要點，可以確保Co-IP實驗的準確性和可靠性，從而得到準確的蛋白質(zhì)相互作用結(jié)果。

CoIP-Mass和CoIP-WB檢測要點：

互作蛋白篩選和驗證：數(shù)據(jù)分析以非標定量信號強度（LFQintensity和FC>10）作為強陽篩選，以文獻查閱，功能匹配，批量CoIP-WB驗證，提高驗證成功率。理想CoIP-MS結(jié)果的蛋白定量都到超過1000種蛋白。其中絕大部分蛋白為非特異結(jié)合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信號強度和差異倍數(shù)作為參考（相對強信號和差異），分析實驗組中明顯定量較高且差異較大的蛋白，作為重要候選蛋白。同時對重要候選蛋白進行STRING互作分析，文獻分析，目的蛋白功能匹配分析，選擇Top的4-5個蛋白進行CoIP-WB驗證，提高CoIP-WB成功率。 Co-IP外源檢測引入外源蛋白驗證互作，敏感度高但需嚴控條件，結(jié)合內(nèi)源檢測更準確！

Co-IP實驗原理主要基于抗原-抗體特異性結(jié)合以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。具體來說，當細胞在非變性條件下被裂解時，細胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用會被保留下來。實驗中，利用靶蛋白的特異性抗體與靶蛋白結(jié)合形成復(fù)合物，然后通過免疫反應(yīng)將復(fù)合物與固定在固相支持物（如瓊脂糖珠或磁珠）上的親和劑（如Protein A/G）結(jié)合。經(jīng)過一系列的洗滌步驟后，可以去除非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)，將目標蛋白質(zhì)及其相互作用的蛋白質(zhì)富集在固相支持物上。通過電泳、質(zhì)譜分析等技術(shù)對富集的蛋白質(zhì)進行分析，從而鑒定和定量相互作用的蛋白質(zhì)。Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)應(yīng)用場景。天津互作機制CoIP-MS

Co-IP技術(shù)廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學、藥物研發(fā)、蛋白質(zhì)組學等領(lǐng)域，助力科研人員探索生命奧秘！湖北免疫共沉淀CoIP

免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。當細胞在非變性條件下被裂解時，完整細胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。當用預(yù)先固化在agarose beads上的蛋白質(zhì)A的抗體免疫沉淀A蛋白，那么與A蛋白在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)B也能一起沉淀下來。再通過蛋白變性分離，對B蛋白進行檢測，進而證明兩者間的相互作用。這種方法得到的目的蛋白是在細胞內(nèi)與興趣蛋白天然結(jié)合的，符合體內(nèi)實際情況，得到的結(jié)果可信度高。這種方法常用于測定兩種目標蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合；也可用于確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。湖北免疫共沉淀CoIP