聚合酶鏈式反應(yīng):1976年,中國科學(xué)家,發(fā)現(xiàn)了穩(wěn)定的Taq DNA聚合酶,為PCR技術(shù)發(fā)展也做出了基礎(chǔ)性貢獻。PCR是利用DNA在體外攝氏95°高溫時變性會變成單鏈,低溫(經(jīng)常是60°C左右)時引物與單鏈按堿基互補配對的原則結(jié)合,標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導(dǎo)致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散再調(diào)溫度至DNA聚合酶很適反應(yīng)溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補鏈?;诰酆厦钢圃斓腜CR儀實際就是一個溫控設(shè)備,能在變性溫度,復(fù)性溫度,延伸溫度之間很好地進行控制。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)可以將缺失、插入或點突變引入DNA序列。無錫細胞熒光定量PCR
聚合酶鏈式反應(yīng)的試驗污染:陽性對照:在建立PCR反應(yīng)實驗室及一般的檢驗單位都應(yīng)設(shè)有PCR陽性對照,它是PCR反應(yīng)是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個重要的參考標志。陽性對照要選擇擴增度中等、重復(fù)性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標本,如以重組質(zhì)粒為陽性對照,其含量宜低不宜高(100個拷貝以下)。但陽性對照尤其是重組質(zhì)粒及高濃度陽性標本,其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大。因而當某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定,檢驗人員心中有數(shù)時,在以后的實驗中可免設(shè)陽性對照。陰性對照:每次PCR實驗務(wù)必做陰性對照。它包括:標本對照:被檢的標本是血清就用鑒定后的正常血清作對照;被檢的標本是組織細胞就用相應(yīng)的組織細胞作對照。試劑對照:在PCR試劑中不加模板DNA或RNA,進行PCR擴增,以監(jiān)測試劑是否污染。揚州骨頭RT-PCR檢測技術(shù)聚合酶鏈式反應(yīng)中兩個引物之間不應(yīng)存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。
聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:MgCl2濃度過高??蛇m當降低其用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50 ng,而基因組DNA則應(yīng)<200 ng。引物濃度不夠優(yōu)化。對引物進行梯度稀釋重復(fù)PCR反應(yīng)。循環(huán)次數(shù)過多;增加模板量減少循環(huán)次數(shù)至30,縮短退火時間及延伸時間,或改用二種溫度的PCR循環(huán)。退火溫度過低。電泳體系有問題:凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大;凝膠沒有凝固好;瓊脂糖質(zhì)量差。若為PCR試劑盒則可能:由于運輸儲存不當引起試劑盒失效;試劑盒本身質(zhì)量有問題,如引物選擇、循環(huán)參數(shù)等選擇不當。降解的陳舊模板擴增也易產(chǎn)生涂布。
聚合酶鏈式反應(yīng)是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術(shù)。工具/原料:擴增緩沖液,四種dNTP,引物,模板DNA,Taq DNA聚合酶, Mg離子,蒸餾水。模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備;模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。聚合酶鏈式反應(yīng)準備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。
聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)是一種用于放大擴增特定的DN段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的很大特點是能將微量的DNA大幅增加?;蚬こ蹋荷锊牧稀猰RNA,將mRNA反轉(zhuǎn)錄后成為cDNA(互補DNA),通過PCR擴增。這里不是信使RNA,而是病毒RNA作為生物材料進行PCR聚合酶鏈式反應(yīng)。作用——體外將病毒RNA分子結(jié)構(gòu)進行修飾,其次將目的基因?qū)胧荏w細胞中,進行病。RNA的表現(xiàn)形式:RNA病毒一般由蛋白質(zhì)和RNA組成,現(xiàn)在看下RNA——一條核糖核酸長鏈,核糖核酸長鏈由無數(shù)個核糖核苷酸分子構(gòu)成,其中,一個核糖核苷酸分子由一分子磷酸、一分子核糖(一種五碳糖)、一分子含氮堿基構(gòu)成。脫氧核糖核苷酸分子比核糖核苷酸分子少了一個O分子。聚合酶鏈式反應(yīng)的特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。揚州骨頭RT-PCR檢測技術(shù)
聚合酶鏈反應(yīng)的一個主要限制是,為了產(chǎn)生允許其選擇性擴增的引物,需要關(guān)于目標序列的先前信息。無錫細胞熒光定量PCR
聚合酶鏈式反應(yīng)的常見問題:Mg2+濃度:Mg2+離子濃度對PCR擴增效率影響很大,濃度過高可降低PCR擴增的特 異性,濃度過低則影響PCR擴增產(chǎn)量甚至使PCR擴增失敗而不出擴增條帶。反應(yīng)體積的改變:通常進行PCR擴增采用的體積為20ul、30ul、50ul?;?00ul,應(yīng)用多 大體積進行PCR擴增,是根據(jù)科研和臨床檢測不同目的而設(shè)定,在做小體積如20ul 后,再做大體積時,一定要模索條件,否則容易失敗。物理原因:變性對PCR擴增來說相當重要,如變性溫度低,變性時間短,極有可能出現(xiàn)假陰性;退火溫度過低,可致非特異性擴增而降低特異性擴增效率退火溫度過高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴增效率。有時還有必要用標準的溫度計,檢測一下擴增儀或水溶鍋內(nèi)的變性、退火和延伸溫度,這也是PCR失敗的原因之一。無錫細胞熒光定量PCR