實(shí)時(shí)熒光定量PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點(diǎn)檢測(cè)的局限,實(shí)現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測(cè)一次熒光信號(hào)的強(qiáng)度,并記錄在電腦軟件之中,通過(guò)對(duì)每個(gè)樣品Ct值的計(jì)算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此,實(shí)時(shí)熒光定量PCR無(wú)需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個(gè)基礎(chǔ)之上的:Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達(dá)Ct值所在的循環(huán)數(shù)時(shí),剛剛進(jìn)入真正的指數(shù)擴(kuò)增期(對(duì)數(shù)期),此時(shí)微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性極好,即同一模板不同時(shí)間擴(kuò)增或同一時(shí)間不同管內(nèi)擴(kuò)增,得到的Ct值是恒定的。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴(kuò)增對(duì)象。珠海微量熒光定量PCR原理及步驟
Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。如果用于RNA檢測(cè),這被稱為逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)PCR即(Real-timeRT-PCR)是實(shí)時(shí)PCR法,它是指對(duì)DNA或經(jīng)過(guò)反轉(zhuǎn)入(RT-PCR)的RNA通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)DNA的放大過(guò)程,在擴(kuò)增的指數(shù)增長(zhǎng)期就測(cè)量擴(kuò)增產(chǎn)物,因?yàn)閿U(kuò)增指數(shù)增長(zhǎng)期測(cè)量值與特異DNA(RNA)起始量存在相關(guān)性,從而實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測(cè)量和鑒別非常微量的特異性核酸,從而可通過(guò)監(jiān)測(cè)CT值而實(shí)現(xiàn)對(duì)原始目標(biāo)基因的含量定量。實(shí)時(shí)熒光定量PCR法較大的優(yōu)點(diǎn)是克服了終點(diǎn)PCR法進(jìn)入平臺(tái)期或叫飽和期后定量的較大誤差,實(shí)現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術(shù)不單單實(shí)現(xiàn)了對(duì)DNA/RNA模板的定量,而且具有靈敏度和特異性高、能實(shí)現(xiàn)多重反應(yīng)、自動(dòng)化程度高、無(wú)污染、實(shí)時(shí)和準(zhǔn)確等特點(diǎn),該技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床檢驗(yàn)及臨床醫(yī)學(xué)研究方面有著重要的意義。無(wú)錫特殊樣本定量PCR供應(yīng)商聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中的DMSO、甘油等,主要用來(lái)保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):因?yàn)镻CR擴(kuò)增了目的DNA區(qū)域,所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對(duì)于法醫(yī)檢定法,當(dāng)時(shí)只有微量的DNA可作為證據(jù)。聚合酶鏈反應(yīng)也可用于分析古代DNA那已經(jīng)有數(shù)萬(wàn)年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應(yīng)的技術(shù)已經(jīng)成功地應(yīng)用于動(dòng)物身上,例如四萬(wàn)年前猛犸,以及人類DNA,定量聚合酶鏈反應(yīng)或者實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)不要與逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)方法混淆)允許估計(jì)樣品中存在的給定序列的量——這種技術(shù)通常用于定量確定基因表達(dá)的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具,用于測(cè)量每輪PCR擴(kuò)增后DNA產(chǎn)物的積累。聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中。
引物的設(shè)計(jì)注意事項(xiàng):1,引物設(shè)計(jì)要跨內(nèi)含子,不能在一個(gè)外顯子上(我們的實(shí)驗(yàn)是以cDNA為模板來(lái)擴(kuò)增的,如果有DNA污染的話,因?yàn)镈NA上含有分子量很大的內(nèi)含子,不可能完成擴(kuò)增。這對(duì)我們消除整個(gè)實(shí)驗(yàn)的誤差起很大的作用)。2,引物設(shè)計(jì)的時(shí)候要盡可能設(shè)計(jì)在同一退火溫度,方便于以后同時(shí)擴(kuò)增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大,就得分開(kāi)做,浪費(fèi)模板,浪費(fèi)管家基因,所以每個(gè)實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)引物的時(shí)候要盡可能一致,這樣就不用每次查退火溫度,且對(duì)整個(gè)實(shí)驗(yàn)有利。聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)生物學(xué)研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎(chǔ)發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項(xiàng)應(yīng)用技術(shù)。自誕生后Real-time PCR技術(shù)持續(xù)發(fā)展,從簡(jiǎn)單的增擴(kuò)到整個(gè)PCR過(guò)程,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對(duì)識(shí)別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個(gè)循環(huán)增擴(kuò)曲線的增長(zhǎng)。事實(shí)并非如此,早期的軟件不能在運(yùn)行期間提供可視化的增擴(kuò)曲線。主要是因?yàn)镾DS軟件采用整個(gè)平臺(tái)較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作,而不是分析每個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)循環(huán)。對(duì)某些設(shè)備來(lái)說(shuō),必須向分析軟件提供實(shí)時(shí)的數(shù)據(jù),有些設(shè)備則不需要。前一種設(shè)備允許軟件實(shí)時(shí)跟蹤每個(gè)加樣口的增擴(kuò)曲線,同時(shí)顯示在電腦屏幕上。定量聚合酶鏈反應(yīng)或者實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)不要與逆轉(zhuǎn)錄允許估計(jì)樣品中存在的給定序列的量。深圳分子生物學(xué)熒光PCR原理
PCR的另一個(gè)限制是,即使是很少量的污染DNA也可以被擴(kuò)增,導(dǎo)致誤導(dǎo)或模糊的結(jié)果。珠海微量熒光定量PCR原理及步驟
Real-time PCR原理:所謂實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。DNA結(jié)合染料法,應(yīng)用一種帶有熒光的、非特異的DNA結(jié)合染料檢測(cè)PCR過(guò)程中積累的擴(kuò)增產(chǎn)物。檢測(cè)所有雙鏈DNA擴(kuò)增產(chǎn)物,包括非特異反應(yīng)產(chǎn)物,如引物二聚體??蓪?duì)任何雙鏈DNA進(jìn)行定量;不需要探針,因此減少了實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及運(yùn)轉(zhuǎn)成本;適合于大量基因的分析;簡(jiǎn)單易用。實(shí)時(shí)熒光定量PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過(guò)內(nèi)參或者外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴(kuò)增過(guò)程中,通過(guò)熒光信號(hào),對(duì)PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時(shí)期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。珠海微量熒光定量PCR原理及步驟
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