Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴(kuò)增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴(kuò)增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴(kuò)增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強(qiáng)度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴(kuò)增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。定量聚合酶鏈反應(yīng)或者實時聚合酶鏈反應(yīng)不要與逆轉(zhuǎn)錄允許估計樣品中存在的給定序列的量。無錫血液Real-time PCR設(shè)計公司
Real-time PCR與普通PCR的實驗?zāi)康牟煌?,所以對引物的設(shè)計要求也不同。普通PCR的實驗?zāi)康闹皇菫榱双@得目的基因產(chǎn)物,允許有非特異擴(kuò)增,只要目標(biāo)條帶清晰明亮,就可以通過切膠回收的方法回收目標(biāo)條帶,之后進(jìn)行后續(xù)的克隆、測序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進(jìn)行擴(kuò)增,只有這樣的擴(kuò)增后續(xù)由Ct值推算出的起始量模板量才準(zhǔn)確,基于此,Real-time PCR對非特異性擴(kuò)增和引物二聚體的存在有較嚴(yán)格的要求。廣州血液數(shù)字PCR研究方案所謂Real-time PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入螢光基團(tuán)。
Real-time PCR相對定量中的標(biāo)準(zhǔn)曲線法如何進(jìn)行:主要是相對定量標(biāo)準(zhǔn)品的制作,一般有三種方法:1、比較復(fù)雜的方法:質(zhì)粒,采用Biotnt提供內(nèi)參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對目的基因進(jìn)行Real-time PCR實驗,得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;PCR擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)入質(zhì)粒中,得到相對定量的標(biāo)準(zhǔn)品;2、一般采用的方法1:比較強(qiáng)的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,如果在方法2中找不到比較強(qiáng)的CDNA模板,則選用PCR產(chǎn)物作為相對定量的標(biāo)準(zhǔn)品也是可以的;需要注意的事項是:PCR產(chǎn)物濃度很高,而Real-time PCR的產(chǎn)物片段比較短,容易在稀釋的過程中造成PCR污染,要注意操作。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)又稱多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項利用DNA雙鏈復(fù)制的原理,在生物體外復(fù)制特定DN段的核酸合成技術(shù)。透過這項技術(shù),可在短時間內(nèi)大量擴(kuò)增目的基因,而不必依賴大腸桿菌或酵母菌等生物體。聚合酶鏈反應(yīng)是是一種簡單,廉價和可靠的方法復(fù)制DN段,這個概念適用于現(xiàn)物學(xué)和相關(guān)科學(xué)的許多領(lǐng)域。PCR可能是分子生物學(xué)中使用很較廣的技術(shù)。這種技術(shù)被用于生物醫(yī)學(xué)研究,犯罪取證和分子考古學(xué)。通常,PCR由一系列20-40次重復(fù)的溫度變化組成,稱為熱循環(huán),每個循環(huán)通常由兩個或三個離散的溫度步驟組成。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。
Real-time PCR:實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。如果用于RNA檢測,這被稱為逆轉(zhuǎn)錄實時PCR即(Real-timeRT-PCR)是實時PCR法,它是指對DNA或經(jīng)過反轉(zhuǎn)入(RT-PCR)的RNA通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實時監(jiān)測DNA的放大過程,在擴(kuò)增的指數(shù)增長期就測量擴(kuò)增產(chǎn)物,因為擴(kuò)增指數(shù)增長期測量值與特異DNA(RNA)起始量存在相關(guān)性,從而實現(xiàn)定量檢測。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸,從而可通過監(jiān)測CT值而實現(xiàn)對原始目標(biāo)基因的含量定量。實時熒光定量PCR法較大的優(yōu)點是克服了終點PCR法進(jìn)入平臺期或叫飽和期后定量的較大誤差,實現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術(shù)不單單實現(xiàn)了對DNA/RNA模板的定量,而且具有靈敏度和特異性高、能實現(xiàn)多重反應(yīng)、自動化程度高、無污染、實時和準(zhǔn)確等特點,該技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床檢驗及臨床醫(yī)學(xué)研究方面有著重要的意義。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)又稱多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。徐州骨頭RT-PCR檢測技術(shù)方案
由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。無錫血液Real-time PCR設(shè)計公司
內(nèi)標(biāo)在傳統(tǒng)定量中的作用,由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,即PCR到達(dá)平臺期后進(jìn)行檢測,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴(kuò)增到達(dá)平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復(fù)實驗,所得結(jié)果有很大差異,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標(biāo)后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準(zhǔn)確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。內(nèi)標(biāo)對定量PCR的影響,若在待測樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標(biāo),則PCR反應(yīng)變?yōu)殡p重PCR,雙重PCR反應(yīng)中存在兩種模板之間的干擾和競爭,尤其當(dāng)兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時,這種競爭會表現(xiàn)得更為明顯。但由于待測樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以無法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標(biāo)。也正是這個原因,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標(biāo),但仍然只是一種半定量的方法。無錫血液Real-time PCR設(shè)計公司
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