冷凍電鏡技術總結:電子斷層成像技術則可用來研究一定厚度的亞細胞器在天然狀態(tài)下的內部結構,由于樣品厚度的限制,能看到500-1000nm左右厚度的結構,的也可以了解整個細胞不同層面的內部結構.盡管,我們能夠預言按目前電子冷凍斷層成像技術的發(fā)展會得到許多更誘人的信息。細胞內存在大量分子機器和生物大分子復合物,并且與單個超分子相比要大,更容易對其進行識別。這樣的事實使斷層技術的目標變得簡單了。在不久的將來關于細胞骨架,核孔復合體和核纖層,囊泡聚集和運輸復合物以及其他一些細胞成分的一些基本問題會得到更清晰的闡釋。這兩種方法都不需要對樣品進行結晶,快速含水冰凍的制樣過程既不復雜,又保存了樣品的瞬時天然結構,有利于對復合物的功能進行研究,圖像自動化篩選過程將是今后提高分辨率的關鍵環(huán)節(jié)。而電子晶體學則對具有對稱結構的樣品進行三維重構具有很大的優(yōu)勢,比如二十面體病毒,螺旋對稱結構等,尤其適合膜蛋白的三維結構,并且是電子顯微術中目前只一能達到原子分辨率水平的方法。將冷凍樣品保持低溫放置在透射電子顯微鏡下觀察,從而獲得生物大分子的結構,被稱為冷凍電鏡技術。荊州低溫透射電鏡技術服務中心
冷凍電子顯微鏡技術中電子斷層掃描重構技術:電子斷層掃描技術是從一個物體的投影圖像重構獲得物體內部結構的技術,通過獲取同一物體的多個連續(xù)角度下的二維投影圖來反向重構它的三維結構。簡單地說,電子斷層掃描技術就是將一個物體(樣品)沿著一個與電子束垂直的軸旋轉,每旋轉一個角度,采集這個物體在相對應方向上的二維投影像,通過對這些二維投影圖的處理(相互配準),將不同角度的二維投影圖反向重構(如加權背投影等方法),獲得樣品整體三維結構的技術。電子斷層成像適合于在納米級尺度上研究不具有結構均一性的蛋白、病毒、細胞器以及它們之間組成的復合體的三維結構。與電子晶體學和單顆粒技術相比,這種技術無需樣品顆粒具有結構同一性,也不強調樣品具有一定的對稱性。因此,雖然目前電子斷層成像所獲得的結構的分辨率(約4~10納米)不能與以上兩種技術相比,但其在研究非定形、不對稱和不具全同性的生物樣品的三維結構和功能中有著不可替代的作用。十堰低溫冷凍透射電鏡技術用途冷凍電鏡技術可實現直接觀察液體、半液體及對電子束敏感的樣品,如生物、高分子材料等。
冷凍電子顯微鏡技術中單顆粒重構技術:該技術也叫做單顆粒分析,主要適用于結構具有全同性的生物大分子的結構解析,蛋白質的分子量通常要求在100KD以上,在顆粒數目足夠多的情況下,理論上其分辨率可以達到原子水平。該方法的圖像處理和三維重構計算過程如下:從原始的電鏡照片中將顆粒圖像挑選出來,對其進行二維圖像對中、分類和平均,然后通過計算等價線的方法推算各分類圖的取向,利用傅里葉重構法建立始三維結構模型,通過對原始圖片或分類平均圖與結構模型投影的匹配,優(yōu)化取向參數,進而得到更準確的三維結構模型,如此反復對初始結構模型進行修正,直到收斂獲得較終的結果。單顆粒重構技術近年來發(fā)展迅速,應用普遍,不斷有文章報道利用此技術所獲得的大分子復合物的三維結構。
冷凍電鏡技術是什么呢?冷凍電鏡用于生物樣品三維結構解析,包含單顆粒分析、微晶電子衍射和冷凍電子斷層掃描3種技術。冷凍電鏡單顆粒分析技術(cryo-EMSPA)是一種以單顆粒形式分析生物分子組裝的新方法,通過將負染電鏡篩選獲得的合適濃度的生物分子樣品快速冷凍,使生物大分子以近天然狀態(tài)存在于無定形冰中,然后進行冷凍樣品的篩選、數據收集和三維結構解析,從而獲得高分辨率的生物分子結構。冷凍電鏡單顆粒分析技術能夠從分子層面進行詳細的研究,解析基于結構的藥物研發(fā)的分子基礎,而冷凍電子斷層掃描能夠從亞細胞水平觀察目標分子在原位細胞環(huán)境中的作用位點和作用機制,相信在不久的將來能夠用于進一步確認基于結構的藥物研究的可靠性。微晶電子衍射不只能夠進行小分子微晶結構解析,也可與現有技術互補,進行生物大分子及其復合物的微晶結構解析。冷凍電鏡技術,是在低溫下使用透射電子顯微鏡觀察樣品的顯微技術。
冷凍電鏡技術測定結構的幾種方法:X射線晶體學、NMR、和冷凍電鏡技術各有優(yōu)缺點,將這幾種方法結合共同研究結構與功能將使結構生物學家對所研究的分子有更為全部的理解,而這些信息是單用任何一個方法所無法獲得的。將X射線晶體模型與經電鏡獲得的密度圖重合可以對電鏡三維重構的結構作更詳盡的解釋,例如將牛的水通道(AQP1,與人的有90%同源性)的高分辨率的晶體結構與先前用冷凍電鏡技術重構出來的人的中等分辨率水通道的三維結構進行比較,可以進一步確定冷凍電鏡獲得的中等分辨率的結構,同時也顯示出了冷凍電鏡技術的優(yōu)勢和局限性。另一方面,較低分辨率的電鏡三維重構模型可以用來解釋病毒或大分子的晶體結構。而且,將X射線晶體的精細結構與冷凍電鏡的重構模型結合構建生物大分子復合物在發(fā)揮功生物學功能過程中出現的構像變化模型。這很大程度增加了我們對于復雜分子的活動機制的理解。電子顯微技術,成像技術,計算機技術,生物信息技術等不同學科的結合,將為我們提供研究生命現象與本質的強有力的手段。冷凍電子顯微技術學解析生物大分子及細胞結構的中心是透射電子顯微鏡成像。十堰低溫冷凍透射電鏡技術用途
冷凍電鏡技術的獨特優(yōu)勢:適合于研究結構不規(guī)則的大分子復合物,對于分子量的上限沒有限制。荊州低溫透射電鏡技術服務中心
冷凍電子顯微技術主要包括單顆粒冷凍電鏡技術和冷凍電子斷層掃描技術。單顆粒冷凍電鏡技術首先捕獲大量隨機分布的同一種生物樣品的二維圖像,然后通過圖像處理算法解析其三維結構。近年來,隨著冷凍電鏡設備和計算機軟硬件的快速發(fā)展,特別是隨著直接電子探測器在冷凍電鏡中的應用,單顆粒冷凍電鏡技術邁進了原子分辨率水平,在生物學、醫(yī)學和新藥研發(fā)等領域發(fā)揮著越來越重要的作用。冷凍電鏡通過記錄單個生物樣品在傾斜旋轉過程中投影的一系列二維圖像,采用特殊的算法計算,將二維圖像重構為三維斷層圖像。冷凍電鏡主要研究組織、細胞和微生物中的超微結構,它能夠提供生理環(huán)境下大分子復合物納米、亞納米甚至近原子尺度的原位結構信息以及其與其它大分子的相互作用信息。荊州低溫透射電鏡技術服務中心